Vi er i Madrid på åttitallet, en by der sporene etter Francos diktatur fortsatt er tydelige. Juan De Vere jobber som assistent for den anerkjente filmregissøren Eduardo Muriel. Eduardo er gift med den vakre Beatriz Noguera, et ekteskap som fra utsiden virker helt perfekt. Men Juan oppdager raskt at ikke alt er som det skal være. Eduardo behandler sin kone kaldt og avvisende, og assistenten blir stadig vitne til konflikter dem imellom. Hva er bakgrunnen for det ulykkelige ekteskapet? Juan kjenner en trang til å finne ut mer om dette, noe som fører ham tilbake i historien, dypere og dypere inn i diktaturets mørke. «Det onde er begynt» er beretningen om et ekteskap preget av hat og forakt, den sterke destruktive kraften i begjær og om tilgivelse.